A Comissão Própria de Avaliação (CPA) da FAPEPE é composta por diferentes membros da comunidade acadêmica que atuam de forma autônoma com o objetivo principal de planejar, implantar e desenvolver ações contínuas de autoavaliação, que forneça subsídios para o processo de gestão da Instituição, buscando potencializar o desenvolvimento da Faculdade e minimizar suas falhas.